A UGRHI não apresenta problemas de disponibilidade hídrica superficial. Contudo, existem áreas que podem ser consideradas críticas devido à irrigação, como no ribeirão dos Bagres, e ao uso industrial no ribeirão Três Pontes.

Dos 33 municípios da UGRHI, há apenas um com índice de abastecimento de água abaixo de 80% e 12 com índice de perdas no sistema de abastecimento acima de 30%.

Encontra-se na UGRHI o trecho da Hidrovia Tietê-Paraná, compreendido entre as barragens de Ibitinga e Promissão (130 km).

Em 1998, 29% dos resíduos sólidos domésticos gerados continuavam em condições inadequadas, 54% apresentavam condições controladas e 17% condições adequadas.

A bacia revela índice baixo de remoção de carga orgânica de origem doméstica, 28%, e alto potencial de carga orgânica industrial devido essencialmente ao setor sucroalcooleiro.

Como grande parte de sua área está comprometida com processos erosivos, merece atenção especial o município de Bauru, com alto índice de voçorocas.

Da área da bacia somente 5% encontram-se preservados por vegetação nativa. A UGRHI possui apenas uma Terra Indígena e nenhum outro tipo de unidade de conservação.

Apresenta alta suscetibilidade a inundações em trechos urbanos de alguns afluentes do rio Tietê.