As páginas seguintes apresentam um diagnóstico, de forma resumida, com principais problemas das bacias:

- escassez e poluição da água;
- desmatamento, erosão, assoreamento e inundação;
- superexplotação e poluição das águas subterrâneas;
- disposição de resíduos sólidos;
- atendimento de rede de água.

Complementando o diagnóstico encontram-se os mapas-sínteses, nos quais as áreas críticas representadas foram assim definidas:

- disponibilidade hídrica: quando as demandas suplantam em mais de 50% a disponibilidade superficial mínima;
- tratamento de esgotos: quando o índice de tratamento atinge menos que 30% dos esgotos gerados;
- disposição inadequada de lixo doméstico: quando o Índice de Qualidade de Aterro de Resíduos - IQR é menor ou igual a 6.
- qualidade de água: quando o índice de qualidade das águas superficiais é péssimo ou ruim;
- inundações: alta suscetibilidade por trechos de rio;
- erosão: áreas de alto potencial.

Os problemas de disponibilidade, tratamento de esgotos e disposição inadequada de lixo doméstico são enfocados no âmbito de cada município integrante da UGRHI, indicando a existência de alguma área crítica ou de deficiência. Já nos casos de erosão, qualidade da água e inundações os problemas são localizados na bacia.